В 2018 году Управление Россельхознадзора по Калининградской области контрольно-надзорную деятельность осуществляло в соответствии с законодательством Российской Федерации, нормативными документами Таможенного союза, положениями международных соглашений, а так же с учетом требований Указов Президента Российской Федерации, Постановлений Правительства Российской Федерации.
Ветеринарный, фитосанитарный и земельный надзор (контроль) осуществлялся во взаимодействии с Калининградской областной таможней, ПУ ФСБ России, УМВД России по Калининградской области; УФНС России; прокуратурой, а также с федеральными органами исполнительной власти, ведомствами и органами местного самоуправления, общественными организациями и ассоциациями производителей в поднадзорной сфере. Принимались меры в целях защиты территории региона от заноса опасных болезней животных, распространения карантинных для отечественного растениеводства объектов, обеспечения безопасности продукции животного происхождения и растениеводства.